Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP3Q96CW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP3Q96CW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBGCP3Q96CW5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP3Q96CW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP3Q96CW5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP3Q96CW5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP3Q96CW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP3Q96CW5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP3Q96CW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP3Q96CW5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms