Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ROPN1LQ96C74 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ROPN1LQ96C74 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ROPN1LQ96C74 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ROPN1LQ96C74 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ROPN1LQ96C74 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ROPN1LQ96C74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms