Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf43Q96C57 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C12orf43Q96C57 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C12orf43Q96C57 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf43Q96C57 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C12orf43Q96C57 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C12orf43Q96C57 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms