Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SYTL4Q96C24 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYTL4Q96C24 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYTL4Q96C24 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SYTL4Q96C24 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SYTL4Q96C24 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SYTL4Q96C24 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYTL4Q96C24 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYTL4Q96C24 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYTL4Q96C24 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYTL4Q96C24 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYTL4Q96C24 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYTL4Q96C24 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYTL4Q96C24 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYTL4Q96C24 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYTL4Q96C24 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYTL4Q96C24 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYTL4Q96C24 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SYTL4Q96C24 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
SYTL4Q96C24 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYTL4Q96C24 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms