Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFT1Q96AA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFT1Q96AA3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFT1Q96AA3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFT1Q96AA3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFT1Q96AA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms