Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM63Q969Q1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM63Q969Q1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM63Q969Q1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM63Q969Q1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM63Q969Q1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM63Q969Q1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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