Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2FQ969M7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2FQ969M7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2FQ969M7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2FQ969M7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2FQ969M7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2FQ969M7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms