Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP9XQ93008 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP9XQ93008 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP9XQ93008 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP9XQ93008 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP9XQ93008 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP9XQ93008 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP9XQ93008 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms