Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIT1Q92963 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT1Q92963 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT1Q92963 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT1Q92963 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT1Q92963 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIT1Q92963 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RIT1Q92963 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIT1Q92963 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIT1Q92963 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIT1Q92963 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIT1Q92963 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms