Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
PRG4Q92954 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
PRG4Q92954 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
PRG4Q92954 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PRG4Q92954 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PRG4Q92954 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
PRG4Q92954 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PRG4Q92954 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
PRG4Q92954 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PRG4Q92954 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
PRG4Q92954 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
PRG4Q92954 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
PRG4Q92954 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
PRG4Q92954 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
PRG4Q92954 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PRG4Q92954 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PRG4Q92954 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PRG4Q92954 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
PRG4Q92954 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PRG4Q92954 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PRG4Q92954 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
PRG4Q92954 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PRG4Q92954 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PRG4Q92954 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PRG4Q92954 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRG4Q92954 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRG4Q92954 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRG4Q92954 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
PRG4Q92954 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.74■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRG4Q92954 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PRG4Q92954 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
PRG4Q92954 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms