Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC2Q92769 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC2Q92769 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC2Q92769 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC2Q92769 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC2Q92769 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC2Q92769 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms