Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSPC1Q8WXF1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSPC1Q8WXF1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSPC1Q8WXF1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSPC1Q8WXF1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSPC1Q8WXF1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSPC1Q8WXF1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSPC1Q8WXF1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSPC1Q8WXF1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSPC1Q8WXF1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSPC1Q8WXF1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSPC1Q8WXF1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSPC1Q8WXF1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSPC1Q8WXF1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms