Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBLCP1Q8WVY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
UBLCP1Q8WVY7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBLCP1Q8WVY7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
UBLCP1Q8WVY7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBLCP1Q8WVY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBLCP1Q8WVY7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBLCP1Q8WVY7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms