Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEK9Q8TD19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEK9Q8TD19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEK9Q8TD19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEK9Q8TD19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEK9Q8TD19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK9Q8TD19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK9Q8TD19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms