Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPATA18Q8TC71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPATA18Q8TC71 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPATA18Q8TC71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPATA18Q8TC71 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPATA18Q8TC71 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPATA18Q8TC71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPATA18Q8TC71 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms