Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1Q8TAE8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GADD45GIP1Q8TAE8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GADD45GIP1Q8TAE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms