Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA6DQ8NFY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA6DQ8NFY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6DQ8NFY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA6DQ8NFY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA6DQ8NFY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms