Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACVR1CQ8NER5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACVR1CQ8NER5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACVR1CQ8NER5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ACVR1CQ8NER5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACVR1CQ8NER5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACVR1CQ8NER5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms