Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C17orf47Q8NEP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C17orf47Q8NEP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C17orf47Q8NEP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C17orf47Q8NEP4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C17orf47Q8NEP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C17orf47Q8NEP4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms