Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD9Q8NE22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETD9Q8NE22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETD9Q8NE22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SETD9Q8NE22 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SETD9Q8NE22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD9Q8NE22 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms