Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TTC21AQ8NDW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TTC21AQ8NDW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TTC21AQ8NDW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TTC21AQ8NDW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TTC21AQ8NDW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
TTC21AQ8NDW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TTC21AQ8NDW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TTC21AQ8NDW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
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