Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC5Q8NAU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC5Q8NAU1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC5Q8NAU1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC5Q8NAU1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC5Q8NAU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC5Q8NAU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC5Q8NAU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FNDC5Q8NAU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms