Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D7

NKAIN3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3Q8N8D7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKAIN3Q8N8D7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKAIN3Q8N8D7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKAIN3Q8N8D7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKAIN3Q8N8D7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms