Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAF1Q8N7H5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAF1Q8N7H5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAF1Q8N7H5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PAF1Q8N7H5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAF1Q8N7H5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAF1Q8N7H5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms