Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPUSD2Q8IZ73 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RPUSD2Q8IZ73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPUSD2Q8IZ73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPUSD2Q8IZ73 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPUSD2Q8IZ73 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPUSD2Q8IZ73 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPUSD2Q8IZ73 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPUSD2Q8IZ73 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms