Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYJ3

SYTL1, Synaptotagmin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1Q8IYJ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYTL1Q8IYJ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYTL1Q8IYJ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYTL1Q8IYJ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYTL1Q8IYJ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYTL1Q8IYJ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYTL1Q8IYJ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL1Q8IYJ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYTL1Q8IYJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYTL1Q8IYJ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYTL1Q8IYJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms