Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GATAD2AQ86YP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATAD2AQ86YP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATAD2AQ86YP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATAD2AQ86YP4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATAD2AQ86YP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATAD2AQ86YP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms