Protein–RNA interactions for Protein: Q86XQ3

CATSPER3, Cation channel sperm-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER3Q86XQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CATSPER3Q86XQ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CATSPER3Q86XQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CATSPER3Q86XQ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CATSPER3Q86XQ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CATSPER3Q86XQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CATSPER3Q86XQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CATSPER3Q86XQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms