Protein–RNA interactions for Protein: Q86U06

RBM23, Probable RNA-binding protein 23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM23Q86U06 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM23Q86U06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM23Q86U06 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM23Q86U06 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM23Q86U06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM23Q86U06 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM23Q86U06 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM23Q86U06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms