Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB3

ALPK2, Alpha-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK2Q86TB3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALPK2Q86TB3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALPK2Q86TB3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK2Q86TB3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK2Q86TB3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALPK2Q86TB3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALPK2Q86TB3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms