Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHFQ7M4L6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHFQ7M4L6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHFQ7M4L6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHFQ7M4L6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHFQ7M4L6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHFQ7M4L6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms