Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMUB2Q71RG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMUB2Q71RG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMUB2Q71RG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMUB2Q71RG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMUB2Q71RG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMUB2Q71RG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMUB2Q71RG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms