Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF165Q6ZSG1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF165Q6ZSG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF165Q6ZSG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF165Q6ZSG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF165Q6ZSG1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF165Q6ZSG1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms