Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LBX2Q6XYB7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LBX2Q6XYB7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LBX2Q6XYB7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LBX2Q6XYB7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LBX2Q6XYB7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LBX2Q6XYB7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LBX2Q6XYB7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LBX2Q6XYB7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LBX2Q6XYB7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LBX2Q6XYB7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LBX2Q6XYB7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LBX2Q6XYB7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LBX2Q6XYB7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LBX2Q6XYB7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LBX2Q6XYB7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.4 ms