Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWM7

LCTL, Lactase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTLQ6UWM7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LCTLQ6UWM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LCTLQ6UWM7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LCTLQ6UWM7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCTLQ6UWM7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCTLQ6UWM7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCTLQ6UWM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms