Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSSK4Q6SA08 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSSK4Q6SA08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSSK4Q6SA08 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSSK4Q6SA08 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSSK4Q6SA08 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSSK4Q6SA08 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSSK4Q6SA08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSSK4Q6SA08 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms