Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LCN8Q6JVE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN8Q6JVE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN8Q6JVE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN8Q6JVE9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCN8Q6JVE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCN8Q6JVE9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms