Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGAP6Q5VW22 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGAP6Q5VW22 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP6Q5VW22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP6Q5VW22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP6Q5VW22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms