Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPO2Q5TGU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPO2Q5TGU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPO2Q5TGU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPO2Q5TGU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPO2Q5TGU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPO2Q5TGU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms