Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SOGA3Q5TF21 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SOGA3Q5TF21 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SOGA3Q5TF21 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SOGA3Q5TF21 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SOGA3Q5TF21 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SOGA3Q5TF21 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SOGA3Q5TF21 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SOGA3Q5TF21 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SOGA3Q5TF21 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SOGA3Q5TF21 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SOGA3Q5TF21 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SOGA3Q5TF21 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SOGA3Q5TF21 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SOGA3Q5TF21 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SOGA3Q5TF21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SOGA3Q5TF21 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SOGA3Q5TF21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SOGA3Q5TF21 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SOGA3Q5TF21 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms