Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM78Q5T7P6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM78Q5T7P6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM78Q5T7P6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM78Q5T7P6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM78Q5T7P6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM78Q5T7P6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms