Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDSS1Q5T2R2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDSS1Q5T2R2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDSS1Q5T2R2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDSS1Q5T2R2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDSS1Q5T2R2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms