Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM201Q5SNT2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM201Q5SNT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM201Q5SNT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM201Q5SNT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM201Q5SNT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM201Q5SNT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms