Protein–RNA interactions for Protein: Q5SGD2

PPM1L, Protein phosphatase 1L, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1LQ5SGD2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPM1LQ5SGD2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPM1LQ5SGD2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPM1LQ5SGD2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PPM1LQ5SGD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPM1LQ5SGD2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms