Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KHDC1Q4VXA5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KHDC1Q4VXA5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KHDC1Q4VXA5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KHDC1Q4VXA5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KHDC1Q4VXA5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KHDC1Q4VXA5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms