Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VWC2Q2TAL6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VWC2Q2TAL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VWC2Q2TAL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VWC2Q2TAL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VWC2Q2TAL6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VWC2Q2TAL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VWC2Q2TAL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWC2Q2TAL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms