Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOXA1Q1HG43 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOXA1Q1HG43 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOXA1Q1HG43 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DUOXA1Q1HG43 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOXA1Q1HG43 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOXA1Q1HG43 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUOXA1Q1HG43 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUOXA1Q1HG43 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DUOXA1Q1HG43 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOXA1Q1HG43 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOXA1Q1HG43 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUOXA1Q1HG43 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOXA1Q1HG43 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOXA1Q1HG43 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUOXA1Q1HG43 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms