Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF56Q15929 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF56Q15929 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF56Q15929 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF56Q15929 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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