Protein–RNA interactions for Protein: Q15546

MMD, Monocyte to macrophage differentiation factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMDQ15546 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMDQ15546 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMDQ15546 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMDQ15546 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMDQ15546 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMDQ15546 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMDQ15546 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMDQ15546 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMDQ15546 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMDQ15546 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMDQ15546 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMDQ15546 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMDQ15546 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMDQ15546 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMDQ15546 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMDQ15546 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMDQ15546 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MMDQ15546 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMDQ15546 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMDQ15546 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMDQ15546 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMDQ15546 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MMDQ15546 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MMDQ15546 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MMDQ15546 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMDQ15546 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMDQ15546 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMDQ15546 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMDQ15546 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMDQ15546 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MMDQ15546 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMDQ15546 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MMDQ15546 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MMDQ15546 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MMDQ15546 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MMDQ15546 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MMDQ15546 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MMDQ15546 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MMDQ15546 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MMDQ15546 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MMDQ15546 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MMDQ15546 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MMDQ15546 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MMDQ15546 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MMDQ15546 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MMDQ15546 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MMDQ15546 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MMDQ15546 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MMDQ15546 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MMDQ15546 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MMDQ15546 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MMDQ15546 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MMDQ15546 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MMDQ15546 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MMDQ15546 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MMDQ15546 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MMDQ15546 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MMDQ15546 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MMDQ15546 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MMDQ15546 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MMDQ15546 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MMDQ15546 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MMDQ15546 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MMDQ15546 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MMDQ15546 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MMDQ15546 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MMDQ15546 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MMDQ15546 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MMDQ15546 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MMDQ15546 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MMDQ15546 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MMDQ15546 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MMDQ15546 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MMDQ15546 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MMDQ15546 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MMDQ15546 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MMDQ15546 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MMDQ15546 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MMDQ15546 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MMDQ15546 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MMDQ15546 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MMDQ15546 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MMDQ15546 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MMDQ15546 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MMDQ15546 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MMDQ15546 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MMDQ15546 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MMDQ15546 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MMDQ15546 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MMDQ15546 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MMDQ15546 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MMDQ15546 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms