Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
EEA1Q15075 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.68■■■■■ 4.58
EEA1Q15075 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
EEA1Q15075 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
EEA1Q15075 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.66■■■■■ 4.58
EEA1Q15075 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
EEA1Q15075 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
EEA1Q15075 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.58
EEA1Q15075 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.61■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.61■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
EEA1Q15075 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
EEA1Q15075 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
EEA1Q15075 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
EEA1Q15075 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
EEA1Q15075 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
EEA1Q15075 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
EEA1Q15075 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
EEA1Q15075 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
EEA1Q15075 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
EEA1Q15075 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
EEA1Q15075 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
EEA1Q15075 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
EEA1Q15075 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
EEA1Q15075 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
EEA1Q15075 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.31■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
EEA1Q15075 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC43.22■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
EEA1Q15075 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.17■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
EEA1Q15075 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.13■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
EEA1Q15075 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms